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DIM ASTREA, Agrosciences, Ecologie des Territoires, Alimentation

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Thèse de Pauline Blin

DIM 2014

Pauline Blin
© I2BC
Dynamique des interactions entre Dickeya solani, Dickeya dianthicola et leur hôte Solanum tuberosum

Pauline Blin

DIM 2014

Thèse soutenue le 28 septembre 2017

Dynamique des interactions entre Dickeya solani, Dickeya dianthicola et leur hôte Solanum tuberosum

Résumé

Chez la pomme de terre Solanum tuberosum, la jambe noire et la pourriture molle sont des maladies provoquées par des populations bactériennes associant une ou plusieurs espèces des genres Pectobacterium et Dickeya. Depuis plusieurs décennies en Europe, l’implication des Dickeya s’amplifie, notamment avec l’émergence récente de D. solani dans les années 2000. Aucun moyen de lutte curatif n’est efficace contre ces phytopathogènes, seules des approches prophylactiques sont mises en place par les filières de production. Ces maladies entrainent donc des impacts économiques considérables. Dans ce travail, l’analyse de la structure de populations pathogènes au sein de parcelles de pomme de terre du nord de la France montre que les Dickeya, et plus particulièrement les Dickeya solani, sont en phase d’installation sur le continent européen. Des expériences en serre montrent la forte agressivité et compétitivité des Dickeya solani lorsqu’elles infectent les tubercules de pomme de terre. Cette espèce émergente représente un risque majeur à moyen terme pour la culture de pomme de terre.

Publications

Complete genome anatomy of the emerging potato pathogen Dickeya solani type strain IPO 2222T - Slimane Khayi, Pauline Blin & al. - Standards in Genomic Sciences, 2016

Population genomics reveals additive and replacing horizontal gene transfers in the emerging pathogen Dickeya solani - Slimane Khayi, Pauline Blin & al. - BMC Genomics, 2015

Agrobacterium Uses a Unique Ligand-Binding Mode for Trapping Opines and Acquiring A Competitive Advantage in the Niche Construction on Plant Host - Julien Lang, Armelle Vigouroux, Sara Planamente, Abbas El Sahili, Pauline Blin & al. - PLOS Pathogens, 2014